Durante el gobierno de Rafael Moreno Valle, Puebla se convirtió en el estado con el mayor número de crímenes de odio a nivel nacional con 24 incidentes entre 2014 y 2017, de acuerdo con la Comisión Nacional de Derechos Humanos (CNDH).
El Informe especial sobre la situación de los derechos humanos de las personas Lesbianas, Gay, Bisexuales, Travestis, Transgénero, Transexuales e Intersexuales y Queer (LGBTTTIQ) reveló que Puebla se posicionó como la entidad con el mayor número de irregularidades.
Mientras que en la Ciudad de México se registraron 11 casos con una mayor población, en Puebla duplicó los homicidios con 24 reportes en el mismo periodo, que en el caso de Puebla correspondió al sexenio del panista Rafael Moreno Valle.
La Fiscalía General del Estado de Puebla reportó 29 delitos cometidos en contra de la comunidad lésbico-gay, de los cuales 24 fueron crímenes de odio.
De acuerdo con La Jornada de Oriente, los cinco delitos restantes en Puebla, cuatro fueron averiguaciones previas por discriminación, y uno únicamente por lesiones.
El Informe Especial precisó que las víctimas fueron 21 homosexuales, una lesbiana, tres transgéneros, un transexual y tres travestis.
En 2018 la CNDH recomendó a las autoridades estatales promover cursos de capacitación y sensibilidad al personal ministerial, asesores jurídicos, servicio pericial y policías en apego a los estándares internacionales.