Luego de que los pobladores de Baja California Sur emitieran su veredicto y eligieran a Víctor Manuel Castro como su nuevo gobernador, los integrantes de la oposición pidieron al Instituto Nacional Electoral un recuento de votos. Esta petición fue negada.
Los partidos PAN, PRI y PRD, junto con algunos partidos locales, afirmaron que el proceso electoral del estado presentó irregularidades. Ante esto, Rebeca Barrera Amador, consejera presidenta del INE de Baja California Sur afirmó que se debe respetar la voluntad popular.
No lo podemos realizar, porque la diferencia entre los ganadores de sus más cercanos competidores es muy amplia; el resultado está tan alejado del que se divulgó a través del programa del PREP como para cambiar el sentido de la voluntad popular el cual también coincide con el conteo rápido que realizó el INE.
Por esta razón, la consejera afirmó que no se puede “inventar causal por presión política”.
Cabe señalar que el conteo del PREP posicionó a Víctor Manuel Castro 6.65 puntos arriba de su opositor el candidato panista Francisco Pelayo. En contraste, las encuestas de salida del día de las elecciones daban como ganador a los partidos opositores, por esta razón los partidos PAN, PRI y PRD pretendía el reconteo de boletas electorales.